Gene, Genome und Sequenzen auf der einen, Algorithmen, Computer und Informatik auf der anderen gehören zur Molekularen Phylogenetik, einer spannende Teildisziplin der Bioinformatik. Deren Ziel ist die Rekonstruktion von Stammbäumen aus molekularen Daten.

Rasch wurde eine 2. Auflage dieses Praxisbuches erforderlich. Kapitel über Molekularbiologie, Evolution, Taxonomie und Kladistik ermöglichen einen leichten Zugang. Es folgen detaillierte Einführungen in die Methoden: Parsimonie, Distanzverfahren, Maximum Likelihood und Bayesianische Verfahren. Alles wird anhand von nachvollziehbaren Beispielen mit gängiger Software beschrieben.

Eine neue, aber rasch in Gebrauch kommende Methode der modernen Molekularbiologie und Phyogenetik ist die Rekonstruktion von Stammbäumen aus molekularen Daten, die in riesigen öffentlichen Internet-Datenbanken abgelegt sind und dort nur abgerufen werden müssen Dieses Werk beschreibt leicht nachvollziehbar die dafür gebräuchlichen Methoden und bewertet die nötige Software, die im Internet zugänglich ist Praxisnah anhand einfacher Beispiele Also kein Lehrbuch der allgemeinen Bioinformatik, sondern fokussiert auf den Umgang mit elektronischen Daten im Zusammenhang mit der Phylogenetik (Stammbaum-, Verwandtschaftsforschung der Lebewesen) Includes supplementary material: sn.pub/extras

Autorentext

Prof. Dr. Volker Knoop (geb. 1963) hat in Berlin Biochemie studiert und dort am Institut für Genbiologische Forschung und später an der Universität Ulm gearbeitet. Er ist seit 2002 Leiter der Abteilung Molekulare Evolution an der Universität Bonn und Gründungsdirektor des dortigen IZMB, des Instituts für zelluläre und molekulare Botanik. Dr. Kai Müller (geb. 1975) ist wissenschaftlicher Assistent am Nees-Institut für Biodiversität der Pflanzen der Universität Bonn und leitet dort die Arbeitsgruppe "Systematik und Evolution". Zu seinen Forschungsschwerpunkten gehören Phylogenie und Systematik verschiedener Blütenpflanzengruppen, die Evolution von Chloroplasten-Genomen, sowie die Entwicklung bioinformatischer Methoden und Software.

Inhalt
Die molekularen Grundlagen des Lebens.- Evolution, Taxonomie, Kladistik und Phylogenetik.- Datenbanken, Alignments, Software.- Stammbäume rekonstruieren: das Allerwichtigste in einem Kapitel.- Parsimonieanalyse.- Distanzverfahren.- Maximum Likelihood.- Bayesianische Statistik.- Raten und Zeiten.- Testen und Vergleichen: Modelle, Bäume und Methoden.- Viele Loci, viele Taxa, viele Bäume.- Molekulare Einsichten zu alten und neuen Kladen.