Die gesamte Belegschaft des Erfurter Johannes-Thal-Klinikums bangt um Dr. Niklas Ahrend. Nach dem dramatischen Unfall liegt der Oberarzt im Koma. Vor allem die Chefärztin Prof. Dr. Karin Patzelt tut alles, um Niklas Leben zu retten. Sie mobilisiert alle verfügbaren Kräfte für eine hochkomplizierte OP, bei der über Niklas Zukunft entschieden wird...
In dieser schwierigen Zeit wird Julia Berger mehr Verantwortung auf der Gynäkologischen Station übertragen. Doch kann die junge Ärztin dieser Aufgabe gerecht werden? Ihr Vater, der kaufmännische Direktor Wolfgang Berger, stürzt sich unterdessen Hals über Kopf in seine Scheidung. Die Gerüchteküche brodelt als der plastische Chirurg Dr. Matteo Moreau überraschend mit dem kleinen Sami im Schlepptau auftaucht. Matteo spannt seine Halbschwester, Assistenzärztin Vivienne Kling als Kindermädchen ein, dabei würde die ihre Zeit viel lieber an der Seite von Neurochirurgin Franziska Ruhland verbringen. Während Dr. Theresa Koshka die Suche nach ihrer Mutter weiter vorantreibt, kommt sie dem Onkologen Marc Lindner näher. Elias Bähr ist unterdessen noch immer unentschlossen das Angebot einer amerikanischen Universität anzunehmen. Sein bester Freund Ben Ahlbeck sieht sich derweil privaten Herausforderungen gegenüber als die Gefühle zu seiner Exfreundin, der Oberärztin Dr. Leyla Sherbaz erneut aufflammen. Hat ihre Liebe diesmal eine Chance?
Die fünf jungen Assistenzärzte werden auch in ihrem dritten Jahr weiter über sich hinauswachsen. Sie blicken gespannt in die Zukunft und werden dabei von Niklas & Co nicht aus den Augen gelassen.

Folge 85: Überleben
Folge 86: Erwartungen
Folge 87: Wer wagt, gewinnt
Folge 88: Gegen den Strom
Folge 89: Was wir geben
Folge 90: Herzenswünsche
Folge 91: Risiken und Nebenwirkungen
Folge 92: Carpe Diem
Folge 93: Rückfälle
Folge 94: Klartext
Folge 95: Blinder Fleck
Folge 96: Zuhören
Folge 97: Bis dass die Zeit uns scheidet
Folge 98: Zwei linke Hände
Folge 99: Liebesschmerz
Folge 100: Plan B
Folge 101: Verborgene Wahrheiten
Folge 102:Ein schmaler Grat
Folge 103:"Helfen - oder lassen?
Folge 104: Glaube versetzt Berge
Folge 105:"Gemeinsam durchs Leben"