"G" Callen (Chris ODonnell) und Sam Hanna (LL Cool J) führen ein Team von Eliteagenten an: Special Agent Kensi Blye (Daniela Ruah), LAPD-Kontaktmann Marty Deeks (Eric Christian Olsen), Technikfreak Eric Beale (Barrett Foa) und Analytikerin Nell Jones (Rene Felice Smith). In dieser Staffel setzen die Agenten alles daran, Abteilungsleiterin Hetty Lange (Linda Hunt) vor einem tödlichen Feind zu beschützen - obwohl eine Ermittlung der Justizbehörde gegen das Team läuft. Und auch NCIS-Vizechef Owen Granger (Miguel Ferrer) tut sein Möglichstes, um eine Abteilung im Zaum zu halten, die jede Grenze überschreitet, um ihre Missionen zu erfüllen und ihre Leute zu schützen.

Episoden:
01 Die Unterwasserbombe
02 Belagerungszustand
03 Die Dinosaurier
04 Eiserne Reserve
05 Das schwarze Budget
06 Der Doppelgänger
07 Kunstflug
08 Der graue Mann
09 Alte Mauern
10 Felsen oder Feder?
11 Humbug
12 Projekt Spiral
13 Der Mann aus Zarzis
14 Der Tunnel
15 Gesprengte Ketten
16 Das Lächeln des Kriegers
17 Drei Soldaten
18 Die rollende Bombe
19 Die Hacker
20 Der richtige Mann
21 Schwarzes Gold
22 Unter falscher Flagge
23 Der Tanker
24 Konstantin Chernoff