Les travaux présentés dans ce livre concernent le développement d'un modèle couplé hydrodynamique-biogéochimie à 3D. Le modèle hydrodynamique est basé sur les équations de continuité et de quantité mouvement écrites en coordonnées sigma. Le modèle biogéochimique est basé sur deux éléments nutritifs l'azote et le phosphore en interaction avec le phytoplancton et le zooplancton. Comme une application du modèle couplé, et pour le valider sur la lagune de Bizerte, une série de campagnes de mesures hydrobiologiques a été réalisée. La comparaison des résultats des simulations aux observations a montré que le modèle reproduit de manière satisfaisante la variation saisonnière des paramètres physico-chimiques et biologiques. D'après les résultats des simulations, une pluie chargée en nutriments augmente la biomasse du phytoplancton, une vague de chaleur accélère les blooms des planctons alors que l'effet d'un réchauffement climatique global est négligeable. Ce document peut être utile aux chercheurs et aux ingénieurs travaillant dans le domaine de la modélisation hydrodynamique et biogéochimique des milieux lacustres et marins.