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User-Level Workflow Design

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Beschreibung

The continuous trend in computer science to lift programming to higher abstraction levels increases scalability and opens programming to a wider public. In particular, service-oriented programming and the support of semantics-based frameworks make application development accessible to users with almost no programming expertise. This monograph establishes requirement-centric scientific workflow design as an instance of consequent constraint-driven development. Requirements formulated in terms of user-level constraints are automatically transformed into running applications using temporal logic-based synthesis technology. The impact of this approach is illustrated by applying it to four very different bioinformatics scenarios: phylogenetic analysis, the dedicated GeneFisher-P scenario, the FiatFlux-P scenario, and microarray data analyses.



Inhalt

The Bio-jETI Framework.- Phylogenetic Analysis Workflows.- GeneFisher-P.- FiatFlux-P.- Microarray Data Analysis Pipelines.

Produktinformationen

Titel: User-Level Workflow Design
Untertitel: A Bioinformatics Perspective
Autor:
EAN: 9783642453892
Digitaler Kopierschutz: Wasserzeichen
Format: E-Book (pdf)
Hersteller: Springer Berlin Heidelberg
Genre: IT & Internet
Anzahl Seiten: 223
Veröffentlichung: 09.12.2013
Dateigrösse: 17.3 MB

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