Bioinformatik

Die Bioinformatik ist für die Weiterentwicklung der modernen Biowissenschaften von herausragender Bedeutung. In Grundzügen wird sie Teil einer jeden Ausbildung zum Biologen oder Biochemiker werden. Obwohl die Zahl der angebotenen Lehrveranstaltungen rapide zunimmt, gibt es bisher auf dem deutschsprachigen Markt noch kein Lehrbuch zu dieser Thematik. Das vorliegende Werk schließt diese Lücke. Reich bebildert und mit relativ wenig mathematischem Formelaufwand werden die Grundlagen der Bioinformatik gut verständlich aufbereitet. Die Themenauswahl ist dabei auf die Bedürfnisse der experimentell tätigen Biochemiker, Biologen und Mediziner abgestimmt. Auf die wichtigsten Hilfsmittel, die das Internet kostenlos bietet, wird ausführlich eingegangen. Die Inhalte werden in der Abfolge Sequenz - Struktur - Funktion entwickelt: · Sequenzdatenbanken · Genomprojekte · Proteinorientierte Datenbanken · Techniken des eukaryontischen Genomassembly · Strukturdatenbanken · Expressionsanalyse mit DNA Chips · Proteomics · Phylogenie und Sequenz · DNA Computing Die Bioinformatik betrifft die tägliche Arbeit eines jeden Biowissenschaftlers. Es sollte sich daher jeder mit den grundlegenden Ansätzen vertraut machen.

Inhalt
Vorwort Inhaltsverzeichnis Einleitung SEQUENZEN Die molekulare Evolution biologischer Systeme und die Evolution des Planeten Erde Sequenzdatenbanken Das Beispiel GenBank Proteindatenbanken Alignments. Ähnlichkeiten zwischen Sequenzen Die Identifizierung von ORFs in genomischer DNA Markov Modelle STRUKTUREN Wie falten sich Proteine? Strukturdatenbanken RNA Strukturvorhersage Pattern-Suche Die Klassifizierung von Proteinstrukturen GENOMICS Orthologe, Paraloge, globale Struktur von Genomen Cluster von orthologen Gengruppen Wie sequenziert man Genome? FUNCTIONAL GENOMICS DNA Chiptechnologie und Expressionsarrays Das Modell Saccharomyces cerevisiae Anwendungsgebiete für Chiptechnologie Chiptechnologie in der Pharmaforschung Pharmakogenetik. Single nucleotide polymorphisms, SNPs und individualisierte Therapien PROTEOMICS Datenbankgestützte high-tech Sequenzierung von Proteinen Genomweite Two-Hybrid-Analyse Proteinarray Datenbanken für nonhomology Funktionsvorhersage Pathway-Datenbanken PHYLOGENIE Grundlagen Gentree vs. Speziestree. Probleme DNA-COMPUTING. EIN EXOT MIT POTENTIAL